I de faglige udvalg arbejder bestyrelsesmedlemmer og rådsmedlemmer sammen inden for udvalgets område.
Alle udvalgsmedlemmerne er udpeget af bestyrelsen på baggrund af faglig viden eller interesse inden for udvalgsområdet.
Udvalgene kan komme med indstillinger til bestyrelsen til beslutning, men har ikke beslutningskompetence, medmindre bestyrelsen udtrykkeligt delegerer en konkret opgave til et udvalg.
Således træffer for eksempel Erhvervsudvalget afgørelse i sager om anvendelse af Nationalparkens logo. Det sker efter retningslinjer godkendt i bestyrelsen.
Udvalgene behandler ansøgninger, som Nationalparken modtager udefra.
Udvalgene udarbejder desuden forslag til og følger op på nationalparkprojekter inden for de enkelte områder.